فحص الجزء العلوي من القناة الهضمية بالمنظار يكشف عن الكثير في مريض اليرقان : دوالي المرئ في تليف الكبد ، أورام المعدة ، ورم حلمة الاثنا عشري ، سرطان رأس البنكرياس قد يضغط على جدار المعدة والاثنا عشري وتجويفها فينبهنا إلى وجوده ، والمنظار أيضاً وسيلة لجمع الخلايا السرطانية وأخذ عينة من أنسجة الأورام المشتبهة ، وأهم من ذلك تلوين قناة البنكرياس والجهاز المراري ـ خارج الكبد وداخله ـ وتحديد مكان الانسداد وسببه إن وجد ، وأحياناً نلجأ إلى تلوين القنوات المرارية عن طريق إبرة ندفعها إلى جسم الكبد باختراق الجلد .